Program Studi Ilmu Sosial (PDIS) merupakan unit pelaksana akademis Jenjang Doktor yang bersifat MULTI DISIPLIN di bawah koordinasi Program Pascasarjana Universitas Cenderawasih. menyelenggarakan aktivitasnya di Kampus Pascasarjana Jalan Raya Abepura, Padang Bulan, Jayapura. Secara resmi didirikan pada Tahun 2012 dengan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia Nomor 135/E/O/2012 Tanggal 23 April 2012. untuk pertama kalinya diakreditasi pada Tahun 2014 dengan nilai C, berdasarkan surat keputusan BAN-PT Nomor 178/SK/BAN-PT/Akred/VI/2014, kemudian pada akreditasi berikutnya, peringkatnya meningkat menjadi “B” berdasarkan surat keputusan BAN-PT Nomor 0613/SK/BAN-PT/Akred/D/II/2017.
Oleh karena Program Pascasarjana memiliki fungsi koordinatif yang disetarakan dengan organisasi tingkat Fakultas di lingkungan Universitas Cenderawasih, maka kedudukan PDIS sejajar dengan Program Studi yang lain. Status dan kedudukan tersebut sebagaimana diatur dalam Peraturan Menteri Pendidikan Nomor 11 Tahun 2010 Tentang Organisasi dan Tata Kerja Universitas Cenderawasih sebagaimana telah diubah dengan Peraturan Menteri Pendidikan Nasional Nomor 27 Tahun 2011 Tentang Organisasi dan Tata Kerja Universitas Cenderawasih. Adapun kedudukan organoisasi PDIS berada di bawah Program Pascasarjana Universitas Cenderawasih, sebagai berikut :
PDIS dikelola oleh seorang Ketua dan dibantu seorang Sekretaris dan 5 orang fungsional staf yang mengurus : Urusan Administrasi Akademik, Administrasi Umum dan Ketenagaan, Administrasi Keuangan dan Aset, serta data dan informasi. Untuk memberikan jaminan terhadap penyelenggaraan PDIS, ditunjang oleh Penjaminan Mutu yang dipimpin oleh seorang Dosen beranggotakan 3 orang. memiliki dosen tetap sebanyak 11 orang bergelar Doktor, terdiri dari 4 (empat) orang Guru Besar, serta masing-masing 3 orang Lektor Kepala dan Lektor. selain itu, didukung oleh Dosen perbantuan dari Universitas Hasanuddin (UNHAS), Universitas Negeri Makassar (UNM), Universitas Indonesia (UI), Universitas Padjadjaran (UNPAD), Uinversitas Gadjah Mada (UGM) dan Universitas Airlangga.